Faktorene som bestemmer DNA-synteseeffektiviteten

I den typiske syntesen av DNA, RNA og ikke-naturlige nukleinsyrer, spiller avbeskyttelses- og koblingstrinnet avgjørende roller.

Avbeskyttelsestrinnet er å fjerne DMT-gruppen på den faste bæreren eller 5'-hydroksylgruppen på det forrige nukleosid med organisk syre, og eksponere hydroksylgruppen for det følgende koblingstrinn.3% trikloreddiksyre i diklormetan eller toluen brukes for det meste for å utføre avbeskyttelsestrinnet.Konsentrasjonen av trikloreddiksyre og avbeskyttelsestiden (avblokkeringstiden) dominerer renheten til sluttproduktene.Lav konsentrasjon og utilstrekkelig deblokkeringstid etterlater ureagert DMT-gruppe, som reduserer utbyttet og øker de uønskede urenhetene.Den lange deblokkeringstiden kan føre til depurin av syntetiserte sekvenser, og danner de uventede urenhetene.

Koblingstrinnet er følsomt for vanninnholdet i løsemidler og fuktigheten i luften.Konsentrasjonen av vann i syntesen bør være mindre enn 40 ppm, bedre mindre enn 25 ppm.For å opprettholde den vannfrie syntesetilstanden, bør nukleinsyresyntesen utføres i et miljø med lav luftfuktighet, så vi anbefaler våre kunder å brukeAmiditter oppløst utstyr, som kan løse opp pulverisert eller oljeaktig fosforamiditt i vannfri acetonitril for å unngå kontakt med luft.

Faktorene som bestemmer effektiviteten av DNA-syntese5
Faktorene som bestemmer DNA-synteseeffektiviteten4

Siden oppløsningen av fosforamiditter er det bedre i ikke-vannsituasjonen, og molekylære feller for å adsorbere sporvannet i reagensene og amiditt, er det nødvendig å forberedeMolekylære feller.Vi anbefaler 2 g undersikt for 50-250ml reagensflasker, 5g for 250-500ml reagensflasker, 10g for 500-1000ml reagensflasker og 20g for 1000-2000ml reagensflasker.

Oppløsningen av fosforamiditter bør utføres under den inerte atmosfæren, og utskiftingen av aktivatorreagenser og acetonitril bør fullføres i tide.Capping- og oksidasjonsreagensene bør brukes så snart som mulig, de åpnede reagensene gir mindre holdbarhet og mindre aktivitet under syntese.


Innleggstid: Aug-09-2022